作为一部科幻电影，电脑特技的地位和实拍不相上下，甚至更为重要，这次李安请来了业界顶尖的工业光魔电脑特效公司，全力打造《绿巨人》的后期制作。正如主演班纳所说，这其实是两部影片，一部完成在摄像机下，一部完成在电脑里。实际拍摄到的班纳的表演成为绿巨人情感和反应的参照系，工业光魔根据这些画面进行数字化，用计算机来重新创造这个角色，先是构造出绿巨人内部的骨骼与肌肉结构，然后让它移动——当然还有外部轮廓。其设计灵感源于西藏人的面具，而它的动作表情则参照演员的真实表演，以使角色更加真实，更富于感情。

　　后期制作中使用最多的电脑特技是"捕捉"方法。工业光魔负责《绿巨人》制作的丹尼斯·穆伦特效小组，放弃了传统的技术，选择降低俘获动作的标准，通过计算机尽量"捕捉"人类的真实动作，然后根据这些动作再运用电脑重新创造虚拟动作和表情，这中间还包括将电极安装到穿有特殊衣服的演员身上。尤为困难的是，这种"捕捉"后的动作设计还得符合人类行为的规律，因为按照影片的标准，"绿巨人"也是人。

　　正如动画监督科林·布莱迪推断说："动作捕捉有它的优势，但是我们不想以它为起点，因为即使它传达给计算机人类在空间的肢体动作，它还有是所限制的。人的身体在穿上那套附有电极的装置以后显得十分笨拙，而且旁边还有很多人在围观。此外，我们还要将自己的创造限制在人类能力范围内。"因此，尽管绿巨人的身躯壮如泰山，其步态和动作也都必须遵循人类的生物物理学原则。

　　为了达到这个效果，工业光魔安排替身演员在一个布满塑料物体的空间大肆破坏，同时记录下暴力动作的全过程并将其在电脑中进一步夸大。开始的时候，工业光魔本想找个健美选手，但他们的动作不够敏捷。李安不想让绿巨人看起来像个肌肉发达的笨重怪物，后来才找了一位私人教练饰演"绿巨人"。实际上，工业光魔为了打造完美的"绿巨人"，投入了非常大的人力物力。仅仅"绿巨人"的皮肤，特效小组就制造了100层，这些皮肤呈现出人类皮肤的特征，包括脉络、伤口、污物、疤痕、毛发等，所有这些皮肤结合体，使得绿巨人看上去栩栩如生，在每个场景中都天衣无缝。另外，为使"绿巨人"流畅地进行所有肢体动作，特效人员还制造了1165块肌肉模型。

　　在近半年的《绿巨人》后期制作中，工业光魔的特效人员总共花费了250个小时，动用了69位技术人员，41位特效人员，35位合成技师，10位制作肌肉的特效人员，9位动画模型师，8位动画总监，6位皮肤绘画师，5位动作捕捉人员和3位技术指导——如此庞大雄厚的技术力量，为《绿巨人》打下了非常坚实的特效基础。此外，环球电影公司和Vivendi环球游戏公司，还征募游戏开发者开发了一套《绿巨人》游戏，同时制作了不同种类的精美玩偶。